食品生產與加工過程中“微污染源”很多，如何防止食品被污染乃是一重要課題。霉菌作為為微污染源中的一種，如果不加以控制勢必會直接影響到產品保質期（長短）。應如何控制霉菌污染？
機電公司的工程部結合以往的食品企業凈化車間裝修經驗認為：控制霉菌污染，首先要了解霉菌的生長環境、污染食品的條件。在此基礎上，方可以提出合理的防控措施，提高食品衛生質量。
一、食品凈化車間的溫濕度控制
控制生產車間的溫度和濕度，溫度在24度以下，濕度在55％以下，因為過高的溫濕度會促進霉菌的生長。
必要時應裝設有效的換氣設施,班中每2小時用風機及時將含有大量水分的空氣排出車間，以防止室內溫度過高、蒸汽凝結或異味等發生。
二、食品生產無塵車間的化學處理
酒精噴霧消毒是制造食品時防止霉菌與細菌污染常用的方法,每天班前、班后對車間內部墻壁、風機、下水道、案面、手部、圍裙套袖、墻壁、下水道實施75%的酒精或消毒劑噴灑，殺滅霉菌。
對于車間環境的天花板、壁面與地板等,為防止霉菌污染,應采用防腐蝕、抗霉菌與防止結露的施工及材料。
三、食品廠凈化車間紫外線照射或臭氧處理
人員的工作服、更衣室等，必須保持衛生清潔，定期清洗和進行紫外線或臭氧殺菌30分鐘以上，防止人為造成霉菌的交叉污染（不可在有人情況下殺菌）。
紫外線對霉菌孢子的殺菌效果有限時，可適當配合酒精噴霧等方法進行處理。
四、潔凈室系統
在食品工廠內的加熱后放冷至包裝階段，為最需防止外部浮游菌侵入和落菌的污染，設置潔凈室，利用空氣導入設施，將可達到空氣潔凈化,減少污染的目的。
五、食品生產車間的衛生控制
首先要保持食品廠車間凈化內部工具的清潔和衛生，注意對一些衛生死角進行嚴格的衛生清理和保持（每半月實施一次深度清潔）。
即管理者與操作人員應具有衛生觀念,隨時注意操作的衛生與減少污染的可能性,必須從加強員工衛生教育著手。
