現如今，隨著市場對潔凈工程技術需求的多樣化發展，創新將成為潔凈技術未來發展的“新常態”，整個行業只有在不斷優化自身服務，為客戶提供更高效的潔凈解決方案，強化自身的技術創新意識才能夠保證潔凈室工程行業自身的健康發展。
客觀地來看，潔凈室工程企業與客戶的緊密結合為潔凈室工程行業的技術創新提供了基礎。目前很多潔凈工程企業在客戶方派有技術人員，參與客戶的工藝流程等方面的改造工作，甚至參與客戶的研發項目，從潔凈的技術角度為客戶提出專業的意見和建議。
從技術角度來看，潔凈室工程企業不僅與下游客戶形成了緊密的合作關系，而且隨著自身技術實力的增強，以及一體化解決方案成為其主要的業務形態，他們也有意識地與上游的供應商形成了穩定的合作關系，共同促進了整個行業的創新發展。從目前行業發展來看，上游專業技術需求客戶、潔凈室工程企業和主要的下游供應商已經形成了相對緊密的行業創新鏈條，產業創新發展的生態已經初步形成。
從我國“十三五”規劃來看，工業和信息化部將航空發動機及燃氣輪機、深海空間站、量子通信與量子計算機、腦科學與類腦研究、深空探測及空間飛行器在軌服務與維護系統、煤炭清潔高效利用、重點新材料研發及應用、天地一體化信息網絡、高檔數控機床、深海探測、核醫學影像設備、新能源汽車等近百項技術作為“十三五”期間的重點，而這些技術和應用會不同程度利用到潔凈室相關技術。這些都為潔凈技術的創新應用提出了新的要求，開拓出新的市場空間。
潔凈室工程行業是一個需求驅動的行業，需求端技術要求的不斷提高為潔凈室行業提出了更多更新的要求，推動潔凈室行業技術創新。作為現代技術的支持性行業，現代技術向微觀化、集成化的發展，對潔凈技術和整個潔凈行業提出了更迫切的要求。
當前半導體技術已經進入了納米的層次，平板顯示技術從TFT向AMOLED等新型顯示技術方向發展，納米新材料技術在各方面的應用，基因技術的發展和普及，以及航天航空技術、智能制造技術等都無不對潔凈技術提出新的要求。這種迅速變革的需求也正在促進整個潔凈室工程行業的轉型升級，成為推動我國，以至于全球潔凈行業的推動力量。而傳統領域對潔凈技術的需求雖然也有所提高，如食品生產和流通、醫療制藥、精密儀器、數據中心、生物工程中心、化妝品生產等領域，但是增長速度維持在一定的水平，屬于傳統的潔凈室需求領域，其對潔凈室技術的要求也相對較低。
因此未來潔凈室工程行業將面臨行業分化的發展狀況，不排除在一些高端領域形成專業性較強潔凈工程公司在一定范圍內壟斷的局面。
